Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP29Q9HBJ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP29Q9HBJ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP29Q9HBJ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP29Q9HBJ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP29Q9HBJ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP29Q9HBJ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP29Q9HBJ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP29Q9HBJ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP29Q9HBJ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP29Q9HBJ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP29Q9HBJ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP29Q9HBJ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP29Q9HBJ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP29Q9HBJ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP29Q9HBJ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP29Q9HBJ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP29Q9HBJ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP29Q9HBJ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP29Q9HBJ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms