Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBE1

PATZ1, POZ-, AT hook-, and zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATZ1Q9HBE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATZ1Q9HBE1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATZ1Q9HBE1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATZ1Q9HBE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATZ1Q9HBE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATZ1Q9HBE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PATZ1Q9HBE1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATZ1Q9HBE1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATZ1Q9HBE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATZ1Q9HBE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATZ1Q9HBE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PATZ1Q9HBE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATZ1Q9HBE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATZ1Q9HBE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATZ1Q9HBE1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATZ1Q9HBE1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATZ1Q9HBE1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATZ1Q9HBE1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms