Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZMAT3Q9HA38 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZMAT3Q9HA38 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZMAT3Q9HA38 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZMAT3Q9HA38 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZMAT3Q9HA38 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZMAT3Q9HA38 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZMAT3Q9HA38 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZMAT3Q9HA38 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZMAT3Q9HA38 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZMAT3Q9HA38 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT3Q9HA38 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT3Q9HA38 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZMAT3Q9HA38 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZMAT3Q9HA38 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZMAT3Q9HA38 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZMAT3Q9HA38 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZMAT3Q9HA38 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZMAT3Q9HA38 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZMAT3Q9HA38 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms