Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXO5Q9H790 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXO5Q9H790 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXO5Q9H790 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXO5Q9H790 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXO5Q9H790 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXO5Q9H790 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXO5Q9H790 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXO5Q9H790 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXO5Q9H790 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXO5Q9H790 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXO5Q9H790 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXO5Q9H790 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXO5Q9H790 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXO5Q9H790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXO5Q9H790 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXO5Q9H790 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXO5Q9H790 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms