Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EBF3Q9H4W6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EBF3Q9H4W6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EBF3Q9H4W6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EBF3Q9H4W6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EBF3Q9H4W6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EBF3Q9H4W6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EBF3Q9H4W6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EBF3Q9H4W6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EBF3Q9H4W6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EBF3Q9H4W6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EBF3Q9H4W6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EBF3Q9H4W6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EBF3Q9H4W6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EBF3Q9H4W6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EBF3Q9H4W6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EBF3Q9H4W6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EBF3Q9H4W6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EBF3Q9H4W6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EBF3Q9H4W6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EBF3Q9H4W6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EBF3Q9H4W6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EBF3Q9H4W6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms