Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRABDQ9H4I3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRABDQ9H4I3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRABDQ9H4I3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRABDQ9H4I3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRABDQ9H4I3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRABDQ9H4I3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRABDQ9H4I3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRABDQ9H4I3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRABDQ9H4I3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRABDQ9H4I3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRABDQ9H4I3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms