Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1Q9H2J1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms