Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRTNQ9H040 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRTNQ9H040 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRTNQ9H040 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPRTNQ9H040 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPRTNQ9H040 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPRTNQ9H040 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRTNQ9H040 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRTNQ9H040 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRTNQ9H040 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRTNQ9H040 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRTNQ9H040 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRTNQ9H040 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRTNQ9H040 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRTNQ9H040 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRTNQ9H040 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms