Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM7Q9C029 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM7Q9C029 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM7Q9C029 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM7Q9C029 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM7Q9C029 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM7Q9C029 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM7Q9C029 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM7Q9C029 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM7Q9C029 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM7Q9C029 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM7Q9C029 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM7Q9C029 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms