Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP9-8Q9BYQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms