Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF4Q9BXJ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1QTNF4Q9BXJ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF4Q9BXJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1QTNF4Q9BXJ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF4Q9BXJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF4Q9BXJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms