Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX7Q9BT81 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX7Q9BT81 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX7Q9BT81 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX7Q9BT81 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX7Q9BT81 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX7Q9BT81 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX7Q9BT81 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX7Q9BT81 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX7Q9BT81 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX7Q9BT81 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX7Q9BT81 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX7Q9BT81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX7Q9BT81 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX7Q9BT81 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX7Q9BT81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX7Q9BT81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms