Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC1Q99614 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC1Q99614 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC1Q99614 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC1Q99614 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC1Q99614 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC1Q99614 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC1Q99614 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC1Q99614 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC1Q99614 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC1Q99614 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC1Q99614 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC1Q99614 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC1Q99614 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC1Q99614 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC1Q99614 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC1Q99614 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC1Q99614 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC1Q99614 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC1Q99614 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC1Q99614 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC1Q99614 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC1Q99614 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC1Q99614 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC1Q99614 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC1Q99614 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms