Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMB7Q99436 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMB7Q99436 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMB7Q99436 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMB7Q99436 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMB7Q99436 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMB7Q99436 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMB7Q99436 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMB7Q99436 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMB7Q99436 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMB7Q99436 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMB7Q99436 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PSMB7Q99436 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSMB7Q99436 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMB7Q99436 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMB7Q99436 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB7Q99436 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms