Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PNKPQ96T60 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PNKPQ96T60 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PNKPQ96T60 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNKPQ96T60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNKPQ96T60 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PNKPQ96T60 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PNKPQ96T60 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PNKPQ96T60 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PNKPQ96T60 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PNKPQ96T60 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PNKPQ96T60 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PNKPQ96T60 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PNKPQ96T60 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PNKPQ96T60 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PNKPQ96T60 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNKPQ96T60 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PNKPQ96T60 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNKPQ96T60 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNKPQ96T60 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNKPQ96T60 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNKPQ96T60 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNKPQ96T60 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNKPQ96T60 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNKPQ96T60 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNKPQ96T60 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PNKPQ96T60 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNKPQ96T60 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PNKPQ96T60 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNKPQ96T60 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNKPQ96T60 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNKPQ96T60 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNKPQ96T60 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNKPQ96T60 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNKPQ96T60 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms