Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMF1Q96S06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMF1Q96S06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMF1Q96S06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMF1Q96S06 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMF1Q96S06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMF1Q96S06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMF1Q96S06 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMF1Q96S06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMF1Q96S06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMF1Q96S06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMF1Q96S06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMF1Q96S06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMF1Q96S06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMF1Q96S06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMF1Q96S06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMF1Q96S06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMF1Q96S06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMF1Q96S06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMF1Q96S06 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms