Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RMDN2Q96LZ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RMDN2Q96LZ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RMDN2Q96LZ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RMDN2Q96LZ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RMDN2Q96LZ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RMDN2Q96LZ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RMDN2Q96LZ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RMDN2Q96LZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RMDN2Q96LZ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RMDN2Q96LZ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RMDN2Q96LZ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RMDN2Q96LZ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RMDN2Q96LZ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RMDN2Q96LZ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RMDN2Q96LZ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RMDN2Q96LZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RMDN2Q96LZ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RMDN2Q96LZ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RMDN2Q96LZ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN2Q96LZ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms