Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX27Q96L92 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX27Q96L92 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX27Q96L92 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX27Q96L92 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX27Q96L92 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX27Q96L92 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX27Q96L92 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX27Q96L92 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX27Q96L92 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX27Q96L92 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX27Q96L92 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX27Q96L92 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SNX27Q96L92 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX27Q96L92 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX27Q96L92 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX27Q96L92 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX27Q96L92 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX27Q96L92 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX27Q96L92 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms