Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
KCNH8Q96L42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
KCNH8Q96L42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
KCNH8Q96L42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
KCNH8Q96L42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
KCNH8Q96L42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
KCNH8Q96L42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
KCNH8Q96L42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
KCNH8Q96L42 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
KCNH8Q96L42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
KCNH8Q96L42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
KCNH8Q96L42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms