Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
KCNH8Q96L42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
KCNH8Q96L42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
KCNH8Q96L42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.7
KCNH8Q96L42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
KCNH8Q96L42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
KCNH8Q96L42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
KCNH8Q96L42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
KCNH8Q96L42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
KCNH8Q96L42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
KCNH8Q96L42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
KCNH8Q96L42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
KCNH8Q96L42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
KCNH8Q96L42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
KCNH8Q96L42 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
KCNH8Q96L42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
KCNH8Q96L42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
KCNH8Q96L42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KCNH8Q96L42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
KCNH8Q96L42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
KCNH8Q96L42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
KCNH8Q96L42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
KCNH8Q96L42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
KCNH8Q96L42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
KCNH8Q96L42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
KCNH8Q96L42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
KCNH8Q96L42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms