Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR8

NAF1, H/ACA ribonucleoprotein complex non-core subunit NAF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAF1Q96HR8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NAF1Q96HR8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NAF1Q96HR8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NAF1Q96HR8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NAF1Q96HR8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NAF1Q96HR8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NAF1Q96HR8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NAF1Q96HR8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NAF1Q96HR8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NAF1Q96HR8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NAF1Q96HR8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAF1Q96HR8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAF1Q96HR8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NAF1Q96HR8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAF1Q96HR8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAF1Q96HR8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms