Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL1Q96FI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL1Q96FI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL1Q96FI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL1Q96FI4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL1Q96FI4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEIL1Q96FI4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEIL1Q96FI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEIL1Q96FI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEIL1Q96FI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEIL1Q96FI4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEIL1Q96FI4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL1Q96FI4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms