Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF31Q96EP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF31Q96EP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF31Q96EP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF31Q96EP0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF31Q96EP0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF31Q96EP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF31Q96EP0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF31Q96EP0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF31Q96EP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF31Q96EP0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF31Q96EP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF31Q96EP0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF31Q96EP0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF31Q96EP0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF31Q96EP0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF31Q96EP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF31Q96EP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF31Q96EP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF31Q96EP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF31Q96EP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms