Protein–RNA interactions for Protein: Q96E35

ZMYND19, Zinc finger MYND domain-containing protein 19, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND19Q96E35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZMYND19Q96E35 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZMYND19Q96E35 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZMYND19Q96E35 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZMYND19Q96E35 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZMYND19Q96E35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZMYND19Q96E35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZMYND19Q96E35 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZMYND19Q96E35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZMYND19Q96E35 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZMYND19Q96E35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZMYND19Q96E35 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZMYND19Q96E35 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZMYND19Q96E35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZMYND19Q96E35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZMYND19Q96E35 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND19Q96E35 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMYND19Q96E35 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms