Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXorf40BQ96DE9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXorf40BQ96DE9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXorf40BQ96DE9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CXorf40BQ96DE9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXorf40BQ96DE9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CXorf40BQ96DE9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXorf40BQ96DE9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CXorf40BQ96DE9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXorf40BQ96DE9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXorf40BQ96DE9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXorf40BQ96DE9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXorf40BQ96DE9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXorf40BQ96DE9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXorf40BQ96DE9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXorf40BQ96DE9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXorf40BQ96DE9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXorf40BQ96DE9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXorf40BQ96DE9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXorf40BQ96DE9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms