Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMCO6Q96DC7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO6Q96DC7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO6Q96DC7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO6Q96DC7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO6Q96DC7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO6Q96DC7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO6Q96DC7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO6Q96DC7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO6Q96DC7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO6Q96DC7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO6Q96DC7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO6Q96DC7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms