Protein–RNA interactions for Protein: Q96AT9

RPE, Ribulose-phosphate 3-epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEQ96AT9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPEQ96AT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPEQ96AT9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPEQ96AT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPEQ96AT9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPEQ96AT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPEQ96AT9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPEQ96AT9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPEQ96AT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEQ96AT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPEQ96AT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPEQ96AT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPEQ96AT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPEQ96AT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms