Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TP53INP1Q96A56 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TP53INP1Q96A56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TP53INP1Q96A56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP53INP1Q96A56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP53INP1Q96A56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP53INP1Q96A56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53INP1Q96A56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP53INP1Q96A56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TP53INP1Q96A56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53INP1Q96A56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53INP1Q96A56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TP53INP1Q96A56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53INP1Q96A56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53INP1Q96A56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TP53INP1Q96A56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms