Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDAQ92838 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDAQ92838 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDAQ92838 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDAQ92838 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDAQ92838 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EDAQ92838 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDAQ92838 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDAQ92838 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDAQ92838 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDAQ92838 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDAQ92838 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDAQ92838 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDAQ92838 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EDAQ92838 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDAQ92838 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDAQ92838 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDAQ92838 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDAQ92838 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDAQ92838 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDAQ92838 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDAQ92838 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EDAQ92838 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDAQ92838 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDAQ92838 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EDAQ92838 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDAQ92838 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDAQ92838 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDAQ92838 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDAQ92838 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDAQ92838 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDAQ92838 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDAQ92838 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EDAQ92838 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDAQ92838 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDAQ92838 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EDAQ92838 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDAQ92838 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDAQ92838 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDAQ92838 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDAQ92838 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDAQ92838 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDAQ92838 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EDAQ92838 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EDAQ92838 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDAQ92838 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDAQ92838 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDAQ92838 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDAQ92838 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDAQ92838 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDAQ92838 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDAQ92838 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDAQ92838 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDAQ92838 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDAQ92838 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDAQ92838 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDAQ92838 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDAQ92838 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDAQ92838 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDAQ92838 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EDAQ92838 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDAQ92838 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDAQ92838 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDAQ92838 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDAQ92838 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDAQ92838 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDAQ92838 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDAQ92838 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDAQ92838 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDAQ92838 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDAQ92838 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDAQ92838 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDAQ92838 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDAQ92838 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EDAQ92838 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDAQ92838 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDAQ92838 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDAQ92838 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDAQ92838 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDAQ92838 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDAQ92838 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EDAQ92838 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDAQ92838 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDAQ92838 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EDAQ92838 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EDAQ92838 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDAQ92838 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDAQ92838 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms