Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
WHAMMQ8TF30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
WHAMMQ8TF30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
WHAMMQ8TF30 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
WHAMMQ8TF30 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
WHAMMQ8TF30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
WHAMMQ8TF30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
WHAMMQ8TF30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
WHAMMQ8TF30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
WHAMMQ8TF30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
WHAMMQ8TF30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
WHAMMQ8TF30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
WHAMMQ8TF30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
WHAMMQ8TF30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
WHAMMQ8TF30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
WHAMMQ8TF30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WHAMMQ8TF30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
WHAMMQ8TF30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
WHAMMQ8TF30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
WHAMMQ8TF30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
WHAMMQ8TF30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms