Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PATJQ8NI35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PATJQ8NI35 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PATJQ8NI35 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PATJQ8NI35 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PATJQ8NI35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATJQ8NI35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATJQ8NI35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PATJQ8NI35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PATJQ8NI35 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PATJQ8NI35 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PATJQ8NI35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PATJQ8NI35 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PATJQ8NI35 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PATJQ8NI35 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PATJQ8NI35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PATJQ8NI35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATJQ8NI35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATJQ8NI35 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PATJQ8NI35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PATJQ8NI35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PATJQ8NI35 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PATJQ8NI35 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PATJQ8NI35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms