Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EHBP1Q8NDI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EHBP1Q8NDI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EHBP1Q8NDI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EHBP1Q8NDI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EHBP1Q8NDI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EHBP1Q8NDI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EHBP1Q8NDI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EHBP1Q8NDI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EHBP1Q8NDI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EHBP1Q8NDI1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EHBP1Q8NDI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHBP1Q8NDI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EHBP1Q8NDI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EHBP1Q8NDI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EHBP1Q8NDI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EHBP1Q8NDI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EHBP1Q8NDI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EHBP1Q8NDI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EHBP1Q8NDI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EHBP1Q8NDI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EHBP1Q8NDI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHBP1Q8NDI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHBP1Q8NDI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EHBP1Q8NDI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EHBP1Q8NDI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHBP1Q8NDI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHBP1Q8NDI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EHBP1Q8NDI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EHBP1Q8NDI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms