Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT0

POC1A, POC1 centriolar protein homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1AQ8NBT0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1AQ8NBT0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1AQ8NBT0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1AQ8NBT0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1AQ8NBT0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1AQ8NBT0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1AQ8NBT0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POC1AQ8NBT0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POC1AQ8NBT0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1AQ8NBT0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POC1AQ8NBT0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POC1AQ8NBT0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POC1AQ8NBT0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms