Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRTCAP2Q8N6L1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRTCAP2Q8N6L1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRTCAP2Q8N6L1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRTCAP2Q8N6L1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRTCAP2Q8N6L1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRTCAP2Q8N6L1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRTCAP2Q8N6L1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRTCAP2Q8N6L1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRTCAP2Q8N6L1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRTCAP2Q8N6L1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRTCAP2Q8N6L1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTCAP2Q8N6L1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRTCAP2Q8N6L1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRTCAP2Q8N6L1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms