Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSGALNACT2Q8N6G5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSGALNACT2Q8N6G5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSGALNACT2Q8N6G5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSGALNACT2Q8N6G5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSGALNACT2Q8N6G5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSGALNACT2Q8N6G5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CSGALNACT2Q8N6G5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSGALNACT2Q8N6G5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSGALNACT2Q8N6G5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSGALNACT2Q8N6G5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms