Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHTF2Q8N3S3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHTF2Q8N3S3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHTF2Q8N3S3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHTF2Q8N3S3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHTF2Q8N3S3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PHTF2Q8N3S3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHTF2Q8N3S3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHTF2Q8N3S3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHTF2Q8N3S3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHTF2Q8N3S3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHTF2Q8N3S3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHTF2Q8N3S3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHTF2Q8N3S3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHTF2Q8N3S3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHTF2Q8N3S3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PHTF2Q8N3S3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHTF2Q8N3S3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHTF2Q8N3S3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHTF2Q8N3S3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHTF2Q8N3S3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHTF2Q8N3S3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHTF2Q8N3S3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHTF2Q8N3S3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms