Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2J2Q8N2K1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2J2Q8N2K1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2J2Q8N2K1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2J2Q8N2K1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2J2Q8N2K1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2J2Q8N2K1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2J2Q8N2K1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE2J2Q8N2K1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE2J2Q8N2K1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2J2Q8N2K1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2J2Q8N2K1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms