Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAGSQ8N159 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NAGSQ8N159 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NAGSQ8N159 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NAGSQ8N159 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NAGSQ8N159 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAGSQ8N159 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAGSQ8N159 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NAGSQ8N159 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NAGSQ8N159 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NAGSQ8N159 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NAGSQ8N159 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NAGSQ8N159 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NAGSQ8N159 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NAGSQ8N159 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAGSQ8N159 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAGSQ8N159 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAGSQ8N159 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NAGSQ8N159 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAGSQ8N159 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAGSQ8N159 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NAGSQ8N159 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAGSQ8N159 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms