Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H1FOOQ8IZA3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H1FOOQ8IZA3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H1FOOQ8IZA3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FOOQ8IZA3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FOOQ8IZA3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H1FOOQ8IZA3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H1FOOQ8IZA3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H1FOOQ8IZA3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FOOQ8IZA3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H1FOOQ8IZA3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H1FOOQ8IZA3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H1FOOQ8IZA3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H1FOOQ8IZA3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H1FOOQ8IZA3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms