Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 600.9 ms