Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP3Q8IV61 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP3Q8IV61 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP3Q8IV61 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP3Q8IV61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP3Q8IV61 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP3Q8IV61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRP3Q8IV61 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASGRP3Q8IV61 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGRP3Q8IV61 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRP3Q8IV61 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RASGRP3Q8IV61 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASGRP3Q8IV61 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASGRP3Q8IV61 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRP3Q8IV61 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRP3Q8IV61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRP3Q8IV61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRP3Q8IV61 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RASGRP3Q8IV61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRP3Q8IV61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms