Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZD3Q86UT5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZD3Q86UT5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZD3Q86UT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZD3Q86UT5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZD3Q86UT5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZD3Q86UT5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZD3Q86UT5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZD3Q86UT5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZD3Q86UT5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDZD3Q86UT5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZD3Q86UT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZD3Q86UT5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD3Q86UT5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZD3Q86UT5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms