Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SZRD1Q7Z422 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SZRD1Q7Z422 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SZRD1Q7Z422 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SZRD1Q7Z422 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SZRD1Q7Z422 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SZRD1Q7Z422 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SZRD1Q7Z422 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SZRD1Q7Z422 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SZRD1Q7Z422 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms