Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
OTOP2Q7RTS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
OTOP2Q7RTS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
OTOP2Q7RTS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP2Q7RTS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OTOP2Q7RTS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OTOP2Q7RTS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
OTOP2Q7RTS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP2Q7RTS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP2Q7RTS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
OTOP2Q7RTS6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
OTOP2Q7RTS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
OTOP2Q7RTS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
OTOP2Q7RTS6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
OTOP2Q7RTS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OTOP2Q7RTS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OTOP2Q7RTS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
OTOP2Q7RTS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
OTOP2Q7RTS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
OTOP2Q7RTS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP2Q7RTS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OTOP2Q7RTS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OTOP2Q7RTS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
OTOP2Q7RTS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
OTOP2Q7RTS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
OTOP2Q7RTS6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
OTOP2Q7RTS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
OTOP2Q7RTS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
OTOP2Q7RTS6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
OTOP2Q7RTS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP2Q7RTS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
OTOP2Q7RTS6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP2Q7RTS6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP2Q7RTS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms