Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC129Q6ZRS4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC129Q6ZRS4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC129Q6ZRS4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC129Q6ZRS4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC129Q6ZRS4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC129Q6ZRS4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC129Q6ZRS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC129Q6ZRS4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC129Q6ZRS4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC129Q6ZRS4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC129Q6ZRS4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC129Q6ZRS4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC129Q6ZRS4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC129Q6ZRS4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC129Q6ZRS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC129Q6ZRS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC129Q6ZRS4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC129Q6ZRS4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CCDC129Q6ZRS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC129Q6ZRS4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC129Q6ZRS4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC129Q6ZRS4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC129Q6ZRS4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC129Q6ZRS4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC129Q6ZRS4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms