Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAP2EQ6VUC0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAP2EQ6VUC0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAP2EQ6VUC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFAP2EQ6VUC0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAP2EQ6VUC0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFAP2EQ6VUC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAP2EQ6VUC0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFAP2EQ6VUC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAP2EQ6VUC0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFAP2EQ6VUC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFAP2EQ6VUC0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFAP2EQ6VUC0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms