Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXV0

GFRAL, GDNF family receptor alpha-like, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRALQ6UXV0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GFRALQ6UXV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GFRALQ6UXV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRALQ6UXV0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRALQ6UXV0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRALQ6UXV0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRALQ6UXV0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRALQ6UXV0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRALQ6UXV0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFRALQ6UXV0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRALQ6UXV0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRALQ6UXV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRALQ6UXV0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRALQ6UXV0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRALQ6UXV0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFRALQ6UXV0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GFRALQ6UXV0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms