Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf88Q6PI97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf88Q6PI97 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf88Q6PI97 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf88Q6PI97 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C11orf88Q6PI97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C11orf88Q6PI97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf88Q6PI97 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf88Q6PI97 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C11orf88Q6PI97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf88Q6PI97 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf88Q6PI97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf88Q6PI97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms