Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP1Q6NVU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFSP1Q6NVU6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UFSP1Q6NVU6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UFSP1Q6NVU6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UFSP1Q6NVU6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UFSP1Q6NVU6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UFSP1Q6NVU6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UFSP1Q6NVU6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms