Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND2CQ68D51 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms