Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND2CQ68D51 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2CQ68D51 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2CQ68D51 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2CQ68D51 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2CQ68D51 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND2CQ68D51 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND2CQ68D51 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND2CQ68D51 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND2CQ68D51 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND2CQ68D51 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2CQ68D51 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms