Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DENND4CQ5VZ89 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND4CQ5VZ89 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND4CQ5VZ89 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DENND4CQ5VZ89 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND4CQ5VZ89 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DENND4CQ5VZ89 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND4CQ5VZ89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND4CQ5VZ89 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND4CQ5VZ89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND4CQ5VZ89 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND4CQ5VZ89 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND4CQ5VZ89 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND4CQ5VZ89 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND4CQ5VZ89 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND4CQ5VZ89 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
DENND4CQ5VZ89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms